甘肃省农业科学院小麦研究所成立于2009年3月，下设冬小麦研究室、春小麦研究室2个研究室，2021年因分子育种技术的发展需要，增设了分子育种研究室；在兰外设有清水试验站和黄羊试验站。

历任领导：

所长：周祥椿  杨发荣  杨文雄  展宗冰

党总支书记：张有元  王勇  展宗冰

党总支副书记：曹世勤

副所长：杨文雄   杜久元  王勇  曹世勤   柳娜   张礼军